KSNP 和 hifiasm 集合，提取read中的SNPs，纠错，生成string graph，组装，
先进行read phased，分别对phased的read进行组装，纯合区域复制？
read phased？ 根据一个位点的差异，如果多于3个这个位点可能是SNP，然后查看这个read和其他read之间其他位点SNP差异，判断是否冲突决定是SNP还是错误，是否来自同一个haplotype or error or 不同haplotype。
hifiasm是目前最好的haplotype组装软件
single copy marker gene --> unique k-mer ？ 感觉好像有用，可能大概率没用，有数据集可以试一下。
预测hic contact的真实性，
通过预测dna空间的结构特征来预测。